Les boues mixtes vont passer en digestion afin de réduire la matière organique et produire du biogaz. Elles sont réparties également dans deux digesteurs chauffés à 37°C et restent plus de 25 jours dans ce milieu exempt d’air et brassées avec du biogaz.

Ensuite les boues sont stockées sous forme liquide avant de passer sur une centrifugeuse afin de retirer une partie de l’eau avant leur incinération dans une usine de traitement des boues d’épuration située à Châtillon/Posieux.